天空彩票资讯

您现在的位置是: 首 页 >  天空彩票资讯

我所参加完成两个高质量甘薯野生种全基因组图谱

来源:徐州市农业科学院 时间:2018-11-05 编辑:管理员

      甘薯是世界上一种极为重要的粮食作物,因为复杂的遗传背景,遗传改良工作远远落后于其他主要粮食作物。近日,多国科学家共同绘制出两个高质量染色体水平的甘薯二倍体野生种基因组图谱,分别是三浅裂野牵牛(Ipomoea trifida)和三裂叶薯(Ipomoea triloba,这一结果将为六倍体甘薯改良提供强有力的基因组参考。该成果于112日发表于国际著名学术期刊《自然-通讯》上,也是近年来甘薯作物发表的高影响因子SCI论文之一。

    该成果由来自于美国、中国、澳大利亚、秘鲁、肯尼亚、乌干达六个国家的16支科研团队共同研究取得。该研究于2013年由美国康奈尔大学BTI研究所的费章君博士(该论文的通讯编辑)和江苏徐州甘薯研究中心曹清河博士(该论文的共同第一编辑)设计和实施。据曹博士先容,我国甘薯种植面积约占世界总面积的45%左右,产量占75%左右,复杂的遗传背景一直以来是制约甘薯遗传改良的瓶颈。多国科学家共同绘制的高质量甘薯二倍体野生种基因组图谱,不仅再次揭示了其物种起源的复杂历史,更为栽培种甘薯遗传改良提供了基因组学研究工具,为以后甘薯分子设计育种打下坚实基础。

 

通过二代+三代技术,组装得到的三浅裂野牵牛(Ipomoea trifida)和三裂叶薯(Ipomoea triloba)的基因组大小均为460Mb左右,各含有大约32,30031,400个蛋白质编码基因。通过比较基因组学,揭示甘薯组植物在远古时期全基因组三倍化过程,并发现甘薯属三倍化造成某些基因拷贝数增加可能与甘薯块根发育相关。系统发育分析表明甘薯同源或异源六倍体假说需要进一步研究,但本研究表明栽培甘薯至少来源于两个明显不同祖先种遗传群体。在育种应用方面,通过对16个非洲甘薯品种重测序找到了桔肉甘薯中类胡萝卜素合成相关基因和等位基因,将极大推动高β-胡萝卜素含量甘薯品种培育进程。

     

 该研究得到美国比尔盖茨基金、中国国家自然科学基金、北卡罗来纳甘薯委员会基金、国际马铃薯中心承担的RTB等项目资助。

文章衔接网址:https://www.nature.com/articles/s41467-018-06983-8

 

撰稿人:张安

 

苏公网安备 32039102000183号

 
XML 地图 | Sitemap 地图